Nous sommes au lendemain d'une guerre entre les humains et les humanoïdes. Les humains furent vaincus et conclurent une alliance pour cohabiter avec les humanoïdes. Dans les faits, c'est plutôt leur exploitation et la colère des machines qui grondent. Une armée commune est mise en place et les derniers militaires voulant combattre sont désavoués. Pourtant certains pirates continuent la lutte avec parmis eux, Albator. le capitaine zero, membre de l'armée, est chargé de l'éliminer